为应付新型冠状病毒病毒感染的肺炎疫情，生态环境部于2020年1月28日印发《新型冠状病毒病毒感染的肺炎疫情医疗废物应急处理管理与技术指南(全面推行）》（以下全称《指南》），指导各地及时、有序、高效、无害化处理肺炎疫情医疗废物，规范肺炎疫情医疗废物应急处理的管理与技术拒绝。《指南》具体了肺炎疫情医疗废物应急处理管理拒绝。地方各级生态环境主管部门在本级人民政府统一领导下，协同公共卫生身体健康等部门完备应急处理协商机制，联合的组织好肺炎疫情医疗废物应急处理工作。以设区的市为单位，专责应急处理设施资源，创建肺炎疫情医疗废物应急处理资源表格。
规范肺炎疫情医疗废物应急处理活动，避免疾病传染和环境污染，及时公布应急处理信息。《指南》明确提出了肺炎疫情医疗废物应急处理技术路线。各地因地制宜，在保证处理效果的前提下，可以自由选择可移动式医疗废物处理设施、危险废物烧毁设施、生活垃圾焚烧设施、工业炉窑等设施应急处理肺炎疫情医疗废物，实施定点管理；也可以按照应急处理横跨区域协同机制，将肺炎疫情医疗废物运输至邻近地区医疗废物集中于处理设施处理。将肺炎疫情预防过程中产生的感染性医疗废物与其他医疗废物实施分类分流管理。
为医疗机构自行使用可移动式医疗废物处理设施应急处理肺炎疫情医疗废物获取便捷，免税环境影响评价等申请。《指南》认为了肺炎疫情医疗废物应急处理技术要点。
肺炎疫情预防过程中产生的感染性医疗废物，不应严苛按照《医疗废物专用包装袋、容器和警告标志标准》纸盒。医疗废物运输过程可根据当地实际情况运营电子移往联单或者纸质联单，不应创建台账。医疗废物处理单位要优先搜集和处理肺炎疫情预防过程产生的感染性医疗废物。
危险废物烧毁设施、生活垃圾焚烧设施、工业炉窑等应急处理肺炎疫情医疗废物的活动，不应按照公共卫生身体健康主管部门的拒绝切实做好卫生防疫工作。医疗废物搜集、储存、运输、处理过程不应强化人员卫生防护。
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