为加强湖泊水资源保护和水污染防治，中国将在全面推行河长制的基础上，在湖泊实施湖长制。11月20日召开的十九届中央全面深化改革领导小组第一次会议，审议通过了《关于在湖泊实施湖长制的指导意见》。会议强调，在全面推行河长制的基础上，在湖泊实施湖长制，要坚持人与自然和谐共生的基本方略，遵循湖泊的生态功能和特性，严格湖泊水域空间管控，强化湖泊岸线管理保护，加强湖泊水资源保护和水污染防治，开展湖泊生态治理与修复，健全湖泊执法监管机制。
此前，河长制已在全国推行。相关数据显示，中国省、市、县、乡四级河长人数近27万名。中国环境科学研究院研究员张惠远说，湖长制是在河长制基础上的及时、必要补充。国务院发展研究中心资源与环境政策研究所副所长常纪文23日接受中新社记者采访时表示，湖泊的水环境治理涉及水利、农业、环保、土地、住建等多个部门，湖长制实际上也是一个统筹监管体制机制，主要是解决一个部门解决不了的水生态环境保护问题。
湖长制由地方行政手段负责，但不同于河长制省、市、县、乡四级的管理体系，一些面积较大的湖泊是跨省的，如太湖；还有一些湖泊只局限在一个市县，就没有这么多管理层级，常纪文说，湖长制要与河长制相衔接，因为一些湖泊的水来自河流，还有一些湖泊的水通过河流出去，因此湖泊的水环境治理和生态保护，既有湖泊自身的因素，也需要与河流的治理和保护有机结合。实际上，中国多地已设湖长。今年1月，湖北省印发《关于全面推行河湖长制的实施意见的通知》，明确提出全面实施河湖长制。要求全省所有湖泊全部由县级以上党委、政府领导担任湖长，全省水库全部纳入河湖长制。
湖北有大小湖泊755个，湖泊水域面积2706平方公里。今年8月，浙江省绍兴市也推出了《关于全面推行湖长制管理工作的意见》，在3300多个湖库全面推行湖长制，提出到2020年，全面建成湖库健康保障体系。目前浙江诸暨市1210个湖库已实现湖长制全覆盖，市所有湖库设置湖长，重点加强湖库水污染防治、水环境治理、水资源保护、水生态修复、水环境执法监管等。
至今年年底全市所有湖库将全面消除Ⅴ类及以下水。到2018年，全市重点湖库达到或优于Ⅲ类水质、水功能区水质达标率达到100%。专家表示，原先的河长制，没有完全覆盖湖库，许多湖库存在污染现象，在河长制基础上推行湖长制，重在强化源头治理，巩固水环境治理成果，使责任主体更加明确，管理更加具体有效。
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